2019-2020 sezonunun başında Fenerbahçe'den ayrılarak Başakşehir'e imza atan tecrübeli oyuncu, 28 kez sahaya çıktı. 17 maçta ilk 11 oynayan Topal, son dönemde Okan Buruk tarafından kulübeye çekildi.
Bu sezon 1 asistle oynayan milli futbolcu, Başakşehir'le şampiyon olması durumunda Türk futbol tarihine geçecek.